索源
索源?檢測產品基于DNA甲基化高通量測序，結合圣庭專利Inline-codeTM低起始量檢測技術，可以幫助轉移性腫瘤患者找到腫瘤的組織起源，覆蓋了肺癌、胃癌、食管癌和頭頸部腫瘤等13種腫瘤大類。是國內首個運用表觀遺傳學鑒定診斷不明腫瘤類型的技術。能為中國不明原發(fā)腫瘤患者的病理診斷和臨床治療提供幫助，提升患者的臨床療效與生存獲益
索源
索源?檢測產品基于DNA甲基化高通量測序，結合圣庭專利Inline-codeTM低起始量檢測技術，可以幫助轉移性腫瘤患者找到腫瘤的組織起源，覆蓋了肺癌、胃癌、食管癌和頭頸部腫瘤等13種腫瘤大類。是國內首個運用表觀遺傳學鑒定診斷不明腫瘤類型的技術。能為中國不明原發(fā)腫瘤患者的病理診斷和臨床治療提供幫助，提升患者的臨床療效與生存獲益
谷紅倉
谷紅倉博士作為圣庭醫(yī)療的首席科學家，是甲基化檢測主要發(fā)明人，最先建立以二代測序為基礎的簡化甲基化測序（RRBS）法。目前該方法已成為表觀遺傳學領域最常用的實驗手段之一，谷博士應用甲基化技術在腫瘤早篩和腫瘤組織溯源方面積累了大量研究數(shù)據(jù)，目前在進一步結合圣庭的技術平臺進行商業(yè)化應用和技術創(chuàng)新。
采用獨家核心甲基化專利技術，Nature子刊《Nature Protocols》發(fā)表，圣庭實現(xiàn)超微量 甲基化測序核心技術突破。
圣庭醫(yī)檢所創(chuàng)始人谷紅倉博士在國際頂級期刊 Nature Protocols 發(fā)表文章并公布單細胞甲基化和轉錄組RRBS-SMART 技術方法（PMID: 34244697）。該技術對研究腫瘤細胞起源模式、監(jiān)測突變時間和進度、早期 發(fā)育變化和腫瘤藥物篩選等具有重大意義。索源TM系列產品基于此項甲基化技術的深度應用，目前已申請國家專利。
大型回顧性及前瞻性臨床研究數(shù)據(jù)驗證，性能高效且真實可靠，整體溯源準確性高達90% 以上。
— 回顧性研究：13個癌種超1.8萬例樣本內部驗證，整體溯源準確性超過90%。
— 真實世界研究：10個癌種237例原發(fā)灶不明腫瘤患者，臨床符合率高達91.1%。
TOD-CUP深度學習算法對腫瘤原發(fā)部位判斷準確率高達96.0%
圣庭與浙江大學附屬第一醫(yī)院合作，2020 年在 Brief Bioinform 上發(fā)表成果。作者使用了來自 24 種癌癥 類型的 10,553 份樣本，共鑒定出 538 個特征基因，用于推斷腫瘤組織類型。TOD-CUP 算法在外部臨床驗證中， 對于腫瘤部位明確的石蠟樣本，判斷準確率高達 96.0%。該方法基于對原發(fā)癌和轉移癌樣本的微陣列和轉錄數(shù)據(jù)的分析，在推斷多種癌癥的組織起源上比以往研究具有更高的成功率。目前已申請國家發(fā)明專利。
相較于傳統(tǒng)檢測方法，CUP甲基化溯源檢測更具優(yōu)勢，結合圣庭病理專家團隊會診， 進一步提升穩(wěn)定性及檢出率。
檢測物質
檢出率
適用疾病范圍
診斷客觀性
缺點
PET-CT
影像圖片
低（24-53%）
少，不適用于胃腸道、大 腦、泌尿系統(tǒng)等部位
弱
（需人為主觀判斷）
檢出率低
免疫組化
組化標志物
低（30-40%）
中，多癌種無特異性免疫 組化標志物
弱
（需人為主觀判斷）
檢出率低
腫瘤標志物
蛋白質/激素/多按
低（20-30%）
中，多癌種無特異性腫瘤 標志物
弱
（需人為主觀判斷）
敏感性或特異性偏低
甲基化溯源
DNA
高（綜合準確性 93%）
中，多癌種無特異性免疫組化標志物
強
（系統(tǒng)打分，結果客觀）
-
樣本類型：蠟塊、石蠟切片、手術組織、穿刺活檢組織
樣本用量： 蠟塊：組織塊不小于5X5X5mm)，送檢1-2塊； 手術樣本白片：連續(xù)切片15張，5um; 穿刺樣本白片：連續(xù)切片20張。5um; 穿刺活檢組織：長度≥10mm,至少2條;手術組織:不于5X5X 5mm,1-2塊
樣本保存：新鮮組織，組織離體后10分鐘內置于福爾馬林組織保存管中,常溫運輸;蠟塊和石蠟切片,常溫保存及運輸
適用人群：原發(fā)灶不明的腫瘤、罕見的惡性腫瘤患者、無法明確新發(fā)或復發(fā)的腫瘤、分化程度差。病理診斷困難的腫瘤
Anaive Bayes algorithm for tissue origin dia gnosis (TOD-Bayes) of synchronous multifocal tumors in the hepatobiliary and pancreatic system(IF=7.39)
TOD-CUP:a gene expression rank-based majority vote algorithm for tissue origin diagnosis of cancers of unknown primary(IF=11.6)
Smart-RRBS for single-cell methylome and transcriptome analysis(IF=13.49)